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Umrechnungsfaktoren

Konzentrationsbestimmungen von Nukleinsäuren mittels UV-Photometer
 
DNA µg/ml=OD260 * 50 µg/ml * VF
RNA µg/ml=OD260 * 40 µg/ml * VF
Oligo-Nucleotide µg/ml=OD260 * 33 µg/ml * VF
 
mit OD260 (optische Dichte) Extinktion bei 260 nm, VF=Verdünnungsfaktor.
 
Berechnung der molekularen Verhältnisse von Insert und Vektor (Rahmen, Plasmid) bei Ligationen.
 
x µg DNA=0.662 * y kb=1 pmol
 
x=Menge DNA in µg die 1pmol entspricht, y=Größe der DNA in kb.
 
BEISPIEL:
Ein Vektor ist 3 kb groß, dann ergibt sich: 0.662 * 3=2, d.h. 2 µg des Vektors entsprechen 1 pmol.
Oder ein Insert ist 300 bp groß, dann ergibt sich: 0.662 * 0.3=0.2 µg, d.h. 200 ng des Insert entsprechen 1 pmol. (P.S. 0.662 sind etwa 2/3, d.h. Größe in kb mal 2 nehmen und durch 3 teilen).
 
Berechnung der Template DNA bei einer PCR
 
DNA Kopienanzahl beim humanen haploiden Genom beträgt etwa 3*109 bp (3 Milliarden). Daraus folgt:
1 Kopie entspricht dann 3,21 pg bzw.
1 ng entspricht 312 Kopien.
 
Humane Mitochondrien besitzen ein ringförmiges Genom von etwa 16500 bp. Daraus folgt:
1 Kopie entspricht dann 17,6 ag
1 ng entspricht 5,7 107 Kopien
 
Größenangaben beim Northern-Blot:
 
die S28 Bande entspricht etwa 4.5 kb
die S18 Bande entspricht etwa 1.6 kb.
 
Vorsilben für Potenzen der Zahl Zehn:
 
z: Zepto (1*10-21)
a: Atto (1*10-18)
f: Femto (1*10-15)
p : Pico (1*10-12)
n : Nano (1*10-9)
µ : Mikro (1*10-6)
m : Milli (1*10-3)
c : Centi (1*10-2)
d : Dezi (1*10-1)
k : Kilo (1*10 3)
G: Giga (1*10 6)
 
 
 
 
 
 
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